Основной аргумент против иридологии сводится к тому, что метод работает не совсем точно и совпадения в правильном диагнозе не более, чем обычная случайность.
Сами приверженцы теории зачастую лишь призывают обратить внимание на непосредственную взаимосвязь органов с радужкой, как на возможность заметить приближение недуга вовремя.